Die Stadtverwaltung Wilsdruff ist in 3 Ämter, dem Hauptamt, der Kämmerei und dem Bauamt, strukturiert. Die Bereiche Abwasserzweckverband "Wilde Sau" und Eigenbetrieb Trinkwasserversorgung "Braunsdorfer Höhe" sind dem Beigeordneten zugeordnet. Die Verwaltung wird vom Bürgermeister geführt.